Una de las Federaciones más débiles del Mundo, se fundó recién en 1994 y hasta el momento ha tenido resultados muy malos. El 13 de Noviembre de 1996 disputaron su primer encuentro internacional como locales ante Estonia y fueron goleados 6-1. Su primer compromiso oficial fue ante Armenia el 5 de Septiembre de 1998 por las Eliminatorias rumbo a la Eurocopa 2000 y perdieron 3-1. En esas Eliminatorias perdieron todos sus partidos y de visitante los perdieron por al menos tres goles. Convirtieron tres goles y les metieron veintiocho.
Sus peores goleadas han sido ante Portugal 7-1, Croacia 7-0 y la República Checa 8-1.
Sin embargo, en la clasificación para la Euro del 2004 consiguieron mejores resultados, como una ajustada derrota ante Bélgica por 1-0.
Rumbo al Mundial del 2006 consiguieron su primer triunfo al vencer a Macedonia 1-0 con gol de Marc Bernaus, quien jugaba en la Segunda División de España. Un resumen de ese histórico encuentro:
Ante esta misma Selección empataron de visitante 0-0 y de local igualaron con el mismo marcador ante Finlandia. Sin embargo volvieron a caer en un bache y han perdido todos los partidos que disputaron rumbo a la Eurocopa del 2008 y para las Eliminatorias del Mundial 2010. Tampoco fue la excepción para clasificar para la Eurocopa del 2012 y también para el 2016.
Un resumen: han jugado 136 partidos, ganaron 3 (Bielorrusia, Albania y Macedonia), empataron 12 (con el que más han igualado es con Azerbaiyán en 4 oportunidades) y perdieron 121. Convirtieron 37 goles y les han metido 374.
Jugador con más participaciones: Oscar Sonejee con 106
Máximo goleador: Idefons Lima con 10 goles en 101 partidos
Jugadores destacados: Marc Vales, mediocampista (SJK, Finlandia). Es el único jugador que juega en una liga profesional, la mayoría son de Andorra y algunos de ligas regionales de España.